Nessa temporada, Clark Kent participa de duas realidades opostas: A da destruição do Planeta Terra, causada por Major Zod escravizando os seres humanos e trazendo a morte para sua melhor amiga Chloe Sullivan, e a realidade presente da qual ele necessita mudar para que tais eventos não ocorram no futuro.

Clark, Chloe e Oliver Queen estarão bem ocupados neste ano, pois a ameaça de Zod é real e o mundo precisa mais do que nunca de heróis.

A "Sociedade da Justiça" ensina a esse trio a essência de uma equipe e a confiança que cada um deve depositar no outro para que os dias que virão a seguir sejam cheios de paz.

1 - Salvador

Lois volta para Metrópolis sem o anel da legião e sem memória de onde esteve e do que fez. Clark começa seu treinamento, mas é impedido por Jor-El de continuar por conta dos laços com Lois, e por isso ele decide voltar para Metrópolis para se despedir dela. Enquanto isso, Major Zod chega a mansão Luthor e se depara com Tess. Chloe pede a Clark para usar o anel da Legião para voltar no tempo e salvar seu marido Jimmy da morte, e Lois tem uma visão/pesadelo apocalíptico.

  2 - Metallo

John Corben continua obcecado em desmascarar o heroi misterioso porem acaba sendo atropelado por um caminhão. Após o acidente, ele acorda com um coração de Kryptonita e descobre que agora possui uma superforça. Beneficiando-se com isso, ele vai atrás do heroi misterioso( Clark) para matá-lo, pois na verdade a criptonita está afetando sua mente. Enquanto isso Tess descobre que o responsavel pela transformação de John Corben em um ciborg são cientistas candorianos.

3 - Raiva

Em Metrópolis, um vírus começa a transformar as pessoas em zumbis. Lois, Tesse milhares de pessoas vão sendo infectadas e Chloe e Dr. Hamilton conseguem achar a cura através do sangue de Clark, inserindo uma agulha com kriptonita na pele dele para retirar o sangue.

4 - Eco

Clark adquire um novo poder: O de ouvir pensamentos! Enquanto isso, o Mestre dos Brinquedos busca vingança de Oliver.

5 - Roleta

Após Oliver ser preso depois de um jogo que acarretou posteriormente na morte de uma mulher, Lois pressiona Clark para descobrir o que ele sabe sobre o caso.

6 - Fogo Cruzado

Clark e Lois são convidados para serem apresentadores do noticiário Bom dia Metrópolis.Mia é treinada por Oliver.Tess é ameaçada de morte caso não conte quem é o heroi misteriso a Zod. Lois e Clark se beijam no fim do episódio.

7 - Kandor

Chloe encontra o pai de Clark, Jor-El. Zod alia-se a Tess, para achá-lo o quanto antes por achar que ele possui a chave para seus poderes.Tess encontra Jor-El e pede para que ele se sacrifique pelo seu filho Karl-El, Zod descobre que a chave para seus poderes é o ultimo filho de cripton Karl-El e não Jor-El!

8 - Ídolo

Clark recebe dois ajudantes em sua luta contra o crime: Jayna e Zan(Super Gêmeos), Mas devido à falhas nas missões, o promotor de Metrópolis acaba se tornando uma pedra no caminho. Lois descobre o segredo de Clark mas Chloe põe em prática um plano pra para lhe provar o contário. Lois beija Clark e desmaia após ter novamente as visões apocalipticas!

9 - Pandora

Após Lois ser sequestrada em coma por Tess, ela consegue obter as memórias da jornalista no futuro: Lá, Chloe é líder de um grupo de resistência contra Major Zod, tendo Oliver como aliado. Clark falha em sua missão e abondona os amigos e Tess e Chloe são mortas. Se apossando dessas informações mais tarde, Clark, Chloe e Oliver tentam arranjar uma maneira de mudar o destino em questão.

10 - Discípulo

Arqueiro Negro, mentor de Oliver, em busca de vingança, ataca Chloe, Lois e Mia. E Clark precisa ajudar Oliver a detê-lo.

11 - Sociedade

Sylveester, antes de ser assassinado, pede ajuda a Chloe. Clark e Chloe vão investigar o caso e acabam chegando na base de operações da Sociedade da Justiça, onde se encontram Gavião Negro, Senhor Destino e StarGirl. Posteriormente, Clark, Chloe, Oliver, John Jones e a Sociedade da Justiça se unem para impedir o assassino de matar mais alguém do grupo. Enquanto isso, Lois encontra Amanda Waller.

12 - Guerreiro

Um garoto rouba uma revista em quadrinhos do anjo guerreiro,só que essa revista foi amaldiçoada pelo pai de Zatanna.

13 - Persuasão

Devido a um pó feito de lascas de Kryptonita, Clark adquire o poder de persuadir as pessoas. Devido a isso, Lois se demite do Planeta Diário e Chloe adquire uma lealdade cega para proteger seu amigo.

14 - Conspiração

Bernard Chisholm, um cientista que estava morto volta à vida graças aos cientistas kandorianos. A partir daí, ele começa a sequestrá-los para provar ao mundo que alienígenas existem. Enquanto isso, ao tentar salvar os kandorianos, Zod é baleado, sendo salvo por Clark, que descobre que seu sangue tem poderes curativos.

15 - Fuga Romântica

Clark e Lois vão passar um fim-de-semana em uma cabana longe de Metrópolis para terem um encontro romântico, só que eles não esperavam que Chloe e Oliver tivessem essa mesma ideia. O que complica ainda mais as coisas é a aparição da Banshee Prateada, um espírito do mal que busca vingança de todos os homens da terra, e possui o corpo de Chloe e Lois para tentar concretizar seus planos diabólicos.

16 - Xeque-Mate

Oliver é sequestrado pela organização Xeque-Mate para ser recrutado e revelar a identidade dos membros da Liga da Justiça. Ele consegue escapar e pede ajuda à Clark. Enquanto isso, Chloe é sequestrada também e ao tentar regastá-la, Clark fica cara a cara com Amanda Waller.

17 - Atualização

Quando Lois investigava um laboratório secreto de Tess, uma explosão ocorre e Lois é salva por John Corben. Clark é infectado pela kryptonita vermelha, ao se deparar com os destroços do laboratório. Sob o efeito do mineral, Clark se une a Zod e o leva à Fortaleza da Solidão. Chloe recorre à Tess para evitar que Clark faça alguma idiotice e o único que pode ajudá-las é John.

18 - Charada

Lois é salva pelo Borrão após investigar o ex-Promotor Attorney Raymond Sacks. O Borrão a salva, mas é capturado em um vídeo por um negociador que planeja vender a foto para o Sacks. Lois e Clark investigam o negociador da foto e acabam por parar na mira de Maxwell Lord, um milionário e operário da Xeque-Mate, que está tentando descobrir a identidade do Borrão para eliminá-lo. Enquanto isso, Chloe descobre o segredo de Zod.

19 - Sacrificio

Enquanto Tess e Chloe estão presas na Torre de Vigia, Oliver decide enfrentar Zod. Enquanto isso, Clark descobre que os soldados kryptonianos têm super poderes. Clark fala para Oliver que quer resolver tudo pacificamente, mas logo ve a burrada que fez quando Zod mostra que já tem influência sobre o exército de kandorianos.

20 - Refém

Martha Kent retorna para a cidade com seu novo namorado, Perry White. Lois e Perry começam a trabalhar na mesma matéria sobre a Rainha Vermelha, e formam uma dupla, o que acaba por colocá-los em perigo. Enquanto isso, Chloe pede a ajuda de Clark para procurar o livro de Rao, que pode conter informações de como deter Zod e seu exército.

21 - Salvação

Zod aparece para Lois dizendo que ele é o Borrão e acusa Clark de tentar revelar seus segredos. Tess confronta Zod na Fortaleza para salvar Clark, Zod a queima com sua visão de calor e a deixa para morrer antes de destruir o painel da Fortaleza. Clark leva Tess ao hospital, onde ela diz que há um segundo painel para ativar o Livro de Rao. Mais tarde ela é declarada morta. Zod ataca Lois quando ela descobre que ele não é o Borrão, ela é salva por Clark que à beija e nisso Lois descobre que Clark é o Borrão. A tropa de Zod concorda em ir para um novo lar. Zod usa uma adaga de kryptonita azul assim ele e Clark viram humanos e não serão banidos. Clark intencionalmente se apunhala e cai do prédio, deixando Zod sem proteção e fazendo com que ele seja banido. Enquanto isso, Chloe se desespera quando Oliver é raptado.